O objetivo geral do Programa de Pós-graduação em Odontologia, área de Concentração em Clínicas Odontológicas, é desenvolver atividades educacionais e investigativas visando à análise crítica, ao desenvolvimento e à divulgação do conhecimento, à inovação e à formação de recursos humanos qualificados, em nível de mestrado e doutorado, para o exercício do ensino, pesquisa e extensão. Adicionalmente, os seguintes objetivos específicos devem ser destacados:

- Desenvolver atividades de ensino, pesquisa e extensão, contribuindo para o avanço e a divulgação do conhecimento na área de Odontologia, para a inovação e para a formação de recursos humanos qualificados;

- Disponibilizar uma estrutura pedagógica flexível e integrada nos níveis de mestrado e doutorado, que também forneça embasamento às linhas de pesquisa do Programa;

- Formar profissionais com capacidade de análise crítica, independência, criatividade, liderança e disposição para cooperação, assim como aptos a atuarem em atividades de ensino, pesquisa e extensão em Instituições de Ensino Superior e Institutos de Pesquisa;

- Contribuir para o desenvolvimento da sociedade por meio da formação de profissionais com capacidade de compreensão e atuação no atual contexto político, social e econômico regional, nacional e internacional;

- Possibilitar a integração entre discentes nos diferentes níveis de formação (mestrado e doutorado);

- Adotar e estimular conduta científica, profissional e pessoal baseada em sólidos princípios éticos e humanistas.